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编号:13326496
类风湿关节炎患者外周血单核细胞lncRNA差异表达谱研究(2)
http://www.100md.com 2019年2月1日 《风湿病与关节炎》 2019年第2期
     3 结 果

    3.1 总RNA样本质量分析 通过采用illuminaNovaseq6000测序仪检测,对每个RNA样本的碱基位置、长度等分析,均达到质检标准,能够满足实验需要。

    3.2 差异表达的lncRNA和mRNA 通过lncRNA测序分析发现,lncRNA在RA组与NC组存在明显差异表达。共有9158条差异表达的lncRNA(差异倍数≥2,且P≤0.05),表达上调的有5682条,下调的有3476条;差异表达的mRNA共有7895条。

    分别对其中表达上调、下调倍数最明显的20条lncRNA和mRNAs进行聚类分析图显示,可直观地看到2组lncRNAs与mRNAs的表达差异,同组样本聚在一起,说明样本间基因表达趋势一致。红色到绿色,颜色越深代表差异越明显。

    3.3 生物信息学分析 GO分析发现,差异表达的mRNA主要参与免疫炎症反应、细胞凋亡、氧化应激、细胞代谢、细胞转录调节、骨髓白细胞活化、血小板细胞活化等功能。KEGG信号通路分析显示,差异表达的mRNA主要参与RA、细胞衰老、信号通路等方面功能的基因有显著变化。并在此基础上经Cis、Trans预测 ......
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