类风湿关节炎患者氧化应激关键lncRNAs表达谱的筛选验证及相关性分析(1)
【摘 要】目的:檢测类风湿关节炎患者外周血单个核细胞(PBMCs)氧化应激关键长链非编码RNA(lncRNAs)表达谱的差异,结合临床进行验证,筛选出类风湿关节炎氧化应激分子标志物,并进行相关性分析。方法:采用高通量测序技术分别对3例类风湿关节炎患者和3例健康人的PBMCs进行检测,基因聚类和KEGG通路分析类风湿关节炎氧化应激差异表达的lncRNAs,Cytoscape分析lncRNAs、miRNA、mRNA之间的共表达网络图;采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)对20例类风湿关节炎患者和20例健康人差异表达lncRNAs进行验证,ROC曲线分析lncRNAs作为类风湿关节炎氧化应激分子标志物的潜力,相关性分析lncRNAs与临床指标及患者感受(SPP)之间的关联。结果:①高通量测序结果显示,类风湿关节炎氧化应激相关的差异表达lncRNAs是34个,上调19个,下调15个,差异倍数最高的7条lncRNAs是AC019117.2、LINC00630、AC007952.5、LINC00663、LINC00638、MIAT、PSMG3-AS1;②生物信息学分析显示,氧化应激关键lncRNAs主要富集在weigel oxidative stress response ......
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