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编号:217210
利用生物信息学分析方法研究糖酵解相关基因在宫颈癌组织中的表达谱
http://www.100md.com 2021年5月19日 当代医药论丛 2021年第9期
差异基因,1资料与方法,1数据来源,2生物信息学分析方法,2结果,1筛选差异基因的结果,2对这些差异基因进行GO功能和KEGG通路富集分析的结果,3对这些差异基因进行蛋白互作网络分析的结果,3讨论
     韩小玲,凌志甫,韩俏英

    (广东医科大学,广东 东莞 523808)

    宫颈癌是女性生殖系统常见的三大恶性肿瘤之一。近几年,该病的发病率和死亡率均呈逐渐上升的趋势。据统计,全球每年约有53 万新发宫颈癌患者,每年约有27.5 万宫颈癌患者死亡[1]。近三十年来,我国宫颈癌的发病率提高了10% ~40%,每年新发宫颈癌患者的数量超过14 万,每年死亡的宫颈癌患者数量约为3.7 万。宫颈癌已成为我国年轻女性发病率较高的妇科恶性肿瘤之一[2]。积极地探索宫颈癌发生、发展的机制、新的诊断和治疗靶点具有重要的临床意义。肿瘤组织的代谢情况与正常组织不同,具有代谢重编程的显著特点。肿瘤组织即使在有氧的条件下,仍以糖酵解为主要代谢方式,即存在Warburg 效应[3]。糖酵解是肿瘤组织特有的代谢方式。肿瘤组织糖酵解的程度与其进展情况具有密切的联系。有多个糖酵解相关基因会参与调控糖酵解,并影响宫颈癌的发生和发展。但目前对于这些基因在宫颈癌发生和发展中的具体作用仍未可知。生物信息学分析方法是基于高通量芯片和测序技术发展起来的一种研究方法。生物信息学分析方法的出现为人们探索疾病的发展过程提供了新的方法。本文主要是利用生物信息学分析方法研究多个糖酵解相关基因在宫颈癌组织中的表达谱。

    1 资料与方法

    1.1 数据来源

    从肿瘤基因组图谱计划(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库(https://portal.gdc.cancer.gov/)下载2020年11 月20 日前收集的宫颈癌转录组数据 ......

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