基于网络药理学和分子对接法探讨汉黄芩素抗呼吸道病毒感染的机制
靶点,1材料与方法,1潜在靶点数据的收集,2富集分析,3“化合物—靶点—通路”网络图的构建,4分子对接,2结果,1潜在靶点数据库的建立,2GO富集分析和KEGG通路注释,3网络图的构建及分析,4分子
刘树军,黄 勇,林 琨,杨建宇★(1.南宁市中医医院,广西 南宁 530001 ;2.广西医科大学附属武鸣医院,广西 南宁 530199)
呼吸道感染是儿童最常见的疾病之一,其具体临床表现的差异较大,可为症状轻微的上呼吸道感染,也可发展成比较严重的下呼吸道感染,严重时可引起呼吸衰竭,甚至致人死亡[1]。据统计,全世界每年约有200 万的5 岁以下儿童因呼吸道感染而死亡[2]。绝大多数的呼吸道感染都是由呼吸道病毒(Respiratory virus)引起的[3],临床上常见的呼吸道病毒包括甲型流感病毒(Influenza A Virus,FluA)、乙型流感病毒(Influenza B Virus,FluB)、副流感病毒Ⅰ型(Parainfluenza virus Ⅰ,PIV Ⅰ)、副流感病毒Ⅱ型(Parainfluenza virus Ⅱ,PIV Ⅱ)、副流感病毒Ⅲ型(Parainfluenza virus Ⅲ,PIV Ⅲ)、呼吸道合胞病毒(Respiratory syncytial virus,RSV)、腺病毒(Adenovirus,ADV)等[4]。汉黄芩素(Wogonin,即5,7-二羟基-8- 甲氧基黄铜)是唇形科植物黄芩的主要活性成分之一[5]。该物质属于黄酮类化合物,其分子式是C16H12O5。有研究表明,汉黄芩素具有抗病毒、抗炎、抗肿瘤等多种药理活性,但其是否可以用于呼吸道病毒感染的治疗,仍需进一步探究[6-10]。本研究旨在通过网络药理学结合分子对接法对汉黄芩素抗呼吸道病毒感染的靶点和通路进行系统的生物信息学分析,推测其潜在的作用机制,进而为后续研究提供一定的科学依据和方向。
1 材料与方法
1.1 潜在靶点数据的收集
在Pubchem 网站以“wogonin”为关键词下载汉黄芩素的3D 化合物结构,将其上传至PharmMapper服务器,筛选出Z >0 的数据导入至Uniprot 数据库 ......
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