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编号:1430125
EBV潜伏膜蛋白2的结构与功能分析
http://www.100md.com 2010年9月15日 温州医科大学学报 2010年第3期
基序,酪氨酸,1材料和方法,2结果,3讨论
     郑美霞,刘建晓,巩文词,朱珊丽,李文姝,张丽芳

    (温州医学院 微生物学与免疫学教研室,浙江 温州 325000)

    EBV潜伏膜蛋白2的结构与功能分析

    郑美霞,刘建晓,巩文词,朱珊丽,李文姝,张丽芳

    (温州医学院 微生物学与免疫学教研室,浙江 温州 325000)

    目的:预测和分析EBV潜伏膜蛋白2(LMP2)的结构和功能。方法:采用互联网数据库和生物软件,从SwissProt蛋白质数据库中检索LMP2的氨基酸序列,通过生物软件分析预测其理化性质、二级结构及空间结构。结果:分析显示LMP2由497个氨基酸组成,分子量53011.4 Da,等电点4.85,为疏水性蛋白;具有12个疏水跨膜区,其N端含有免疫受体酪氨酸活化基序(ITAM)和脯氨酸富集基序(PY基序),前者位于氨基酸序列 74~77和85~88处,后者位于56~60和 97~101处;含有15个α螺旋结构和7个β片层结构,通过无规则卷曲连接α螺旋和β片层。结论:通过对LMP2生物信息学的分析,获得了此蛋白的理化特性及部分参与调节跨膜信号传导功能区的信息,为进一步研究EBV的感染与致病机制、研制EBV亚单位疫苗等奠定基础。

    疱疹病毒4型,人;潜伏膜蛋白;蛋白质结构,二级;生物信息学

    EB病毒(Epstein-Barr virus,EBV)是人类γ疱疹病毒,呈全球分布,感染率高,是传染性单核细胞增多症的病原体,并与鼻咽癌、口腔腺体肿瘤、淋巴瘤、何杰金氏病、胃癌以及器官移植后的B细胞淋巴瘤、艾滋病相关的淋巴瘤等密切相关[1]。研究证实,在所有病理类型的鼻咽癌组织中均发现了EBV的DNA,在异型增生组织和原位癌中也存在。EBV在潜伏感染时,表达潜伏膜抗原(the latency membrane protein,LMP)LMP1和LMP2。研究表明LMP1为肿瘤源性蛋白,而LMP2则不具细胞转化作用,因此,LMP2是研究抗EBV感染疫苗的理想靶抗原。本研究利用计算机辅助生物学软件和网络相关数据库对LMP2进行结构预测和功能分析,进一步了解EBV潜伏感染的机制,并对EBV感染相关肿瘤的治疗和疫苗的设计研究提供理论基础。

    1 材料和方法

    1.1 材料 利用在线生物信息学软件:SwissProt蛋白质数据库,Expasy服务器及LOMETS在线预测软件[2-3](http://www.uniprot.org/,http://expasy. org/,http://zhang.bioinformatics.ku.edu/ LOMETS/)对EBV LMP2进行结构预测和功能分析 ......

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