肺鳞癌差异性长链非编码RNA表达谱分析及初步验证
基因芯片,1材料和方法,2结果,3讨论
潘钦石,陈坚,许刚,丁鸿燕,黄卡特,王瑜敏(温州医科大学附属第一医院,浙江 温州 325015,1.医学检验中心;2.病理科)
·论 著·
肺鳞癌差异性长链非编码RNA表达谱分析及初步验证
潘钦石1,陈坚1,许刚1,丁鸿燕1,黄卡特2,王瑜敏1
(温州医科大学附属第一医院,浙江 温州 325015,1.医学检验中心;2.病理科)
目的:探讨及分析肺鳞癌差异性长链非编码RNA(lncRNA)的表达谱并进行初步验证。方法:采用Arraystar高通量lncRNAs基因芯片研究20例肺鳞癌混合组织及对应的癌旁组织,获得lncRNAs差异性表达谱。同时采用实时荧光定量PCR方法对40例肺鳞癌相关的lncRNA分子进行验证。结果:本实验所用的基因芯片包含30 586个lncRNAs和26 109个mRNAs探针;与癌旁组织比较肺鳞癌混合组织出现了1 741条lncRNAs(≥2或≤0.5倍差异)和1 716条mRNAs(≥2或≤0.5倍差异)差异性表达;信号通路分析显示了P53信号通路、细胞周期等发生明显变化。我们初步证实了10个lncRNAs分子在肺鳞癌组织中的表达与基因芯片一致,其中KRT16P2、BC016831是表达差异最为明显的lncRNAs分子。结论:肺鳞癌存在明显的lncRNAs差异性表达,这些lncRNAs及某些信号通路可能在肺鳞癌发生和发展中发挥重要作用。
肺肿瘤;癌,非小细胞肺;长链非编码RNA;基因芯片
根据《2012中国肿瘤登记年报》,2009年中国肺癌的发病率和病死率分列男性肿瘤首位,女性肿瘤第二位和第一位[1]。尽管手术切除术、化学治疗和放射治疗技术在不断改进,但肺癌仍极易复发和致命[2]。非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)在肺癌中最为多见,约占肺癌总数的80%。肺鳞癌是属于NSCLC中的一种常见的类型。目前对于NSCLC治疗的整体效果仍很不理想,5年生存率只有10%~15%[3-4]。
长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)为转录本长度大于200核苷酸的RNA分子,不编码蛋白,存在于核内或胞浆内[5]。其表达异常能够引起一系列疾病包括肿瘤的发生发展[6]。研究表明lncRNAs参与了肺癌的发生发展过程[7],为研究肺癌的生物学行为和发病机制提供了重要契机。目前国内外学者对lncRNAs在非小细胞肺癌中的研究尚处于起步阶段,仅筛选及鉴定部分与肺癌相关的lncRNAs[8-11] ......
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