Illumina高通量测序技术检测医院内空气中微生物
北京医院,监护室,1材料和方法,2结果,3讨论
李燕明,佟训靓,许宏涛,田埂,郎继东,肖飞,蔡虻(1.北京医院 呼吸与危重症医学科,北京 100730; 2.北京医院 老年医学部,北京 100730;3.北京医院 检验科,北京 100730;4.清华大学 生命科学院分析测试中心,北京 100084;5.卫生部老年医学研究所,北京 100730; 6.北京医院 医院感染管理处,北京 100730)
·技术与方法·
Illumina高通量测序技术检测医院内空气中微生物
李燕明1,6,佟训靓2,许宏涛3,田埂4,郎继东4,肖飞5,蔡虻6
(1.北京医院 呼吸与危重症医学科,北京 100730; 2.北京医院 老年医学部,北京 100730;3.北京医院 检验科,北京 100730;4.清华大学 生命科学院分析测试中心,北京 100084;5.卫生部老年医学研究所,北京 100730; 6.北京医院 医院感染管理处,北京 100730)
目的:应用Illumina高通量测序技术对医院内空气环境进行检测,了解医院内不同科室空气中常见微生物的分布特点。方法:利用恒流负压收集器采集北京医院门诊、急诊、外科监护室、呼吸监护室4个科室的空气样本,提取微生物DNA样本,利用Illumina高通量测序技术分析不同科室空气环境中微生物的种类和相对含量。结果:高通量测序的方法可一次性检出上千种微生物,如真菌、细菌、病毒,其优势在于对真菌的鉴定。在外科监护室、呼吸监护室,致病性真菌占空气中真菌的比例较高,分别为60.37%、81.59%,而在门诊、急诊,该比例稍低,分别为53.25%、58.98%。在真菌菌属分类中,霉菌中的曲霉,酵母菌中的隐球菌和念珠菌所占比例较高。结论:高通量测序技术应用于医院环境监测,可提供更多机会性感染的病原菌信息,对改进医院环境监控的技术方法及提高医院感染的监控水平提供实验基础。
高通量测序;医院感染;曲霉;隐球菌;念珠菌
近年来,医院感染发生率不断增高。空气传播是院内感染传播的重要途径之一,但对医院内空气中病原微生物的种类及分布情况的监测是目前院内感染研究的焦点与难点[1]。尽管缺乏空气环境中某些病原微生物含量及种类的变化引发医院相关性感染流行和暴发的因果关系的证据,但业内公认改善医院环境空气质量可以减少医院感染的发生和传播[2]。传统的医院环境的监测方法相对落后,而高通量测序等新技术不断引入医院感染监测和防控,并逐步形成其理论体系是大势所趋。本研究应用高通量测序技术对医院内空气环境进行检测,了解医院内不同科室空气中常见微生物的分布特点 ......
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