郭刚强，谢尙丹，叶思思，孙祥威，张良，张丽芳，薛向阳

    (1.温州医科大学 微生物学与免疫学教研室 分子病毒与免疫研究所 热带医学研究所，浙江 温州325035；2.温州医科大学 第二临床医学院，浙江 温州 325035；3.温州医科大学附属第一医院 胃肠外科，浙江 温州 325015)

    ·论 著·

    人巨细胞病毒US31基因序列特征分析及B细胞表位预测

    郭刚强1，谢尙丹2，叶思思1，孙祥威3，张良3，张丽芳1，薛向阳1

    (1.温州医科大学 微生物学与免疫学教研室 分子病毒与免疫研究所 热带医学研究所，浙江 温州325035；2.温州医科大学 第二临床医学院，浙江 温州 325035；3.温州医科大学附属第一医院 胃肠外科，浙江 温州 325015)

    目的：分析人巨细胞病毒(HCMV)US31基因序列，预测US31基因编码蛋白的B细胞优势表位。方法：基于US31基因编码蛋白的氨基酸序列，结合亲水性参数、可及性参数、抗原性参数、柔韧性参数及二级结构方案对HCMV US31基因编码各型蛋白的B细胞表位进行预测，参照已建立的预测方法综合评价US31基因B细胞优势表位。结果：US31核苷酸序列变异较少，大部分是同义突变，氨基酸序列高度保守；其编码蛋白全长为162个氨基酸，相对分子质量20 kD，等电点7.66，为可溶性蛋白，二级结构中以无规则卷曲为主。经综合分析，US31基因的B细胞优势表位可能存在于氨基酸序列N端的5～19、32～47、58～68、110～124区段。结论：多参数预测HCMV pUS31的B细胞优势表位，为进一步研究蛋白特征、制备单克隆抗体及表位疫苗提供依据。

    人巨细胞病毒；US31基因；B细胞表位

    人巨细胞病毒(human cytomegalovirus，HCMV)属疱疹病毒科β亚科，为双链DNA病毒，基因组全长约230～240 kb，含208个开放读码框，由长独特序列(unique long domains，UL)和短独特序列(unique short domains，US)2个片段组成。US31基因是US1基因家族成员，5’端和3’端分别与US30和US32基因相邻，属于HCMV增殖非关键病毒基因[1-2]。Burgdorf等[3]利用WTC-F HB5和Q548R IE2 C-F HB5病毒感染和空白感染G0期的HFFs细胞，芯片分析结果显示在Q548R IE2 C-F HB5病毒感染HFFS细胞96 h和168 h后，US31基因相对于野生型病毒感染96 h的US31基因表达量 ......