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编号:1428786
程序性死亡受体配体-1 B细胞表位预测与分析
http://www.100md.com 2018年2月7日 温州医科大学学报 2018年第1期
单克隆,氨基酸,1材料和方法,2结果,3讨论
     陈旭东,程开,吕开绩,张丽芳,朱冠保

    (1.温州医科大学附属第一医院 胃肠外科,浙江 温州 325015;2.温州医科大学 微生物学与免疫学教研室 分子病毒与免疫研究所 热带医学研究所,浙江 温州 325035)

    程序性死亡受体(programmed cell death protein 1,PD-1)作为一种免疫检查点,表达于T细胞表面,而T细胞在肿瘤免疫中起到重要的作用。而程序性死亡受体配体-1(programmed cell death ligand 1,PD-L1)作为其配体可与其结合,并抑制T细胞的活性[1-3]。PD-L1是一种I型跨膜蛋白,全长为290个氨基酸,相对分子质量为33 kDa,广泛表达于多种肿瘤细胞表面[4-6]。肿瘤细胞产生的PDL1可以使之免受免疫细胞的细胞杀伤作用,而拮抗PD-L1与其受体PD-1结合,能够让T细胞正常活化,并发挥肿瘤杀伤作用[7]。现在已有针对人PD-1或PD-L1的多种单克隆抗体和小分子亲和体上市或处于临床试验阶段,包括Nivolumab[8-9]、Pembrolizumab[10-11],Atezolizumab[12-13]、Avelumab[14],并在多种肿瘤的治疗中展现出令人瞩目的效果。B细胞表位是抗原上能和抗体的互补决定区互补结合的区域。B细胞表位可用于疫苗的制备,单克隆抗体的研制和小分子亲和体的高通量筛选,具有针对性强、作用稳定等特点,因此B细胞表位的研究是免疫学研究的重要部分。PD-L1 B细胞的表位的研究已有报道[15],但其为构象表位,位于β折叠中,难以用人工合成多肽的方式模拟。故本研究利用生物信息学方法,以PD-L1的全长氨基酸序列为基础,对人和小鼠PD-L1 B细胞表位进行预测和分析,期望找到可以用人工合成多肽模拟的B细胞表位,可为单克隆抗体的研制和高通量小分子亲合体筛选等提供理论依据。

    1 材料和方法

    1.1 人与小鼠PD-L1全长氨基酸序列的获取 人与小鼠PD-L1全长氨基酸序列检索于uniProt蛋白质数据库(http://www.uniprot.org/),提供氨基酸序列编号。

    1.2 人与小鼠PD-L1全长蛋白的二级结构预测 结合EXPASY服务器提供的GOR4、SOPMA、Scratch Protein Predictor(SPP)程序对人与小鼠PD-L1胞外段氨基酸序列进行二级结构的分析 ......

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