肝纤维化模型小鼠肝组织环状RNA表达谱分析
染色,芯片,1材料和方法,2结果,3讨论
周玉平,吕雪幼,璩辉,朱林文,叶国良,郭俊明(1.宁波大学医学院附属医院 消化内科,浙江 宁波 315020;2.宁波大学医学院 生物化学与分子生物学研究所 浙江省病理生理学技术研究重点实验室,浙江 宁波 315211)
环状RNA(circular RNA,circRNA)是近年来非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)领域最新的研究热点。circRNA是一类通过特殊剪切产生的ncRNA分子,大量存在于真核细胞,具有一定的组织、时序、疾病特异性,在疾病的发生发展中发挥着重要的调控作用[1]。circRNA对肝纤维化的发生发展是否具有调控作用目前尚不明确。因此,本研究采用circRNA芯片技术分析肝纤维化模型肝组织的circRNA表达谱,并用生物信息学方法分析差异表达circRNA的可能生物学功能,以期从circRNA角度解析肝纤维化的发病机制,为肝纤维化研究提供新的方向和思路。
1 材料和方法
1.1 材料
1.1.1 实验动物:SPF级C57BL/6雄性小鼠,体质量为(20±2)g,购于北京维通利华实验动物技术有限公司,生产许可证号:SCXK(京)2016-0006,饲养及实验在宁波大学医学院实验动物中心进行,并获得宁波大学动物伦理委员会批准同意。
1.1.2 主要试剂和仪器:四氯化碳(CCl4)分析纯(上海国药集团),橄榄油化学纯(上海国药集团),苏木精(美国Sigma公司),丽春红(美国Sigma公司),苯胺蓝(美国Sigma公司),Trizol(美国Invitrogen公司),核酸外切酶RNase R(美国Epicentre公司),ds-cDNA合成试剂盒(美国Invitrogen公司) ......
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