朱珊丽，丁宁，项丹，董海艳，薛向阳，张丽芳

    (温州医科大学 微生物学与免疫学教研室 分子病毒与免疫研究所，浙江 温州 325035)

    2019年末开始，我国暴发了新型冠状病毒(SARS-CoV-2)感染肺炎疫情，形势严峻。SARS-CoV-2属β冠状病毒属，其长约30 kb的基因组中仅10 kb为编码区，编码结构蛋白与辅助蛋白，其编码的结构蛋白分别为：刺突蛋白(S protein)、膜蛋白(M protein)、包膜蛋白(E protein)和核衣壳蛋白(Nucleocapsid)[1-3]。其中，S蛋白可被宿主蛋白酶裂解为S1与S2两个亚单位，其中S1亚单位位于包膜刺突的顶端，介导病毒与宿主细胞表面的病毒受体结合，是决定病毒入侵易感细胞的关键蛋白；而S2亚单位则形成刺突的茎部，介导病毒包膜与宿主细胞膜融合，促使病毒进入宿主细胞。因此，SARSCoV-2的S刺突蛋白在病毒对宿主细胞的吸附和侵入过程中发挥着重要作用，而通过阻断病毒对宿主细胞的吸附和穿入是特异性预防SARS-CoV-2感染的重要途径。本研究拟利用生物信息学预测分析SARSCoV-2 S蛋白二级结构及可能的B细胞表位，为研究该蛋白的功能及疫苗开发提供理论依据。

    1 材料和方法

    1.1 SARS-CoV-2 S蛋白氨基酸序列 从NCBI数据库(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NC_045512)获得SARS-CoV-2 S区域的核苷酸及相应的氨基酸序列(NC_045512.2) ......