俞盛健，麻怀露，陈王洋，丁晓飞，陈光，梁勇

    (1.温州医科大学 第一临床医学院，浙江 温州 325035；2.台州学院 医学院，浙江 台州 318000；3.河北北方学院 研究生院，河北 张家口 075000)

    胶质瘤是头部最常见的原发性恶性肿瘤[1]。目前，主要的脑胶质瘤治疗方式有手术、化疗、放疗、靶向治疗等，但是胶质瘤患者的预后仍较差，其中胶质母细胞瘤平均生存时间不超过18个月[2]。因此，探讨脑胶质瘤发生发展的潜在分子机制来发现有效的诊断和治疗靶点非常重要。长链非编码RNA(long non-coding RNA，lncRNA)是一类长度超过200个碱基的非编码RNA。虽然它不参与蛋白质的编码，但是近来许多研究发现lncRNA参与了体内多种生命活动，如胚胎干细胞的多样性、细胞周期的调节，以及癌症的发生发展等[3]。癌组织中lncRNA的差异表达可以通过调控DNA的突变，如改变增强子和启动子的活性或者染色质状态广泛影响转录来实现[4]。同样，lncRNA的差异表达也可以用来预测因组织DNA突变而导致的癌症发生。如今越来越多的研究证实lncRNA可以作为癌症的诊断标志物，甚至作为一种治疗选择[5]。例如在早期手术切除的乳腺癌中，lncRNA HOTAIR的过表达对于肿瘤转移和整体生存率具有很高的预测作用[6]。lncRNA PCA3作为前列腺癌患者尿中的一类生物标志物，与血清前列腺特异性抗原相比具有更高的特异性和预测价值，现已成为在前列腺癌诊断中一个非常有效可靠的指标[7]。

    癌症基因图谱(the Cancer Genome Atlas，TCGA)是开放的公共数据平台，其包括30种癌症11 000例患者信息，对于这些巨大数据的挖掘分析，有助于研究者全面研究各种癌症发生的分子机制，确定新的治疗靶点和与肿瘤相关的分子标志物，从而提高对多种人类恶性疾病的诊断能力和治疗效果[8]。基因型组织表达(GTEx)数据库研究来自449名生前健康的人类捐献者的7 000多份尸检样本，GTEx对几乎所有转录基因的基因表达模式进行了观察，从而能够确定基因组中影响基因表达的特定区域。在本研究中，我们通过对联合GTEx和TCGA数据库中的脑胶质瘤样本进行基因转录水平的差异表达分析，构建了可用于预测患者预后的风险模型，并提取了可能与胶质瘤恶性进展有关的lncRNA靶点。

    1 材料和方法

    1.1 数据收集 从GDC Data Portal(https://portal.gdc.cancer.gov/)中下载人类脑胶质瘤的RNA-Seq数据和临床数据 ......