12个候选单核苷酸多态性位点与中国儿童急性淋巴细胞白血病易感性和预后的关系
危险度,等位基因,1资料和方法,2结果,3讨论
王桢,吴蕊池,莫一啸,陈静,汤燕静,沈树红,1.温州医科大学附属第二医院育英儿童医院 儿童血液科,浙江 温州 325027;2.上海交通大学医学院附属上海儿童医学中心 血液肿瘤科,上海 200127
急性淋巴细胞白血病(acute lymphoblastic leukemia,ALL)是儿童最常见的恶性肿瘤[1-3],且发病率呈逐年上升趋势。近年来基于危险度分层及危险度调整的个体化治疗方案使得儿童ALL的治疗取得了显著改善,在发达国家,总生存率(overall survival rate,OS)达90%,长期无事件生存率(event-free survival rate,EFS)达80%[4]。上海儿童医学中心(SCMC)一项研究显示ALL患儿OS达80%,长期EFS达64.6%[5],但仍有相当多的患儿在治疗期间经历复发、死亡、耐药、第二肿瘤等。
ALL发病是多种环境和遗传因素相互作用的结果[6]。近年来全基因组关联研究(genome-wide association study,GWAS)表明,胚系单核苷酸多态性可能影响儿童ALL的易感性,有21个SNP位点和儿童ALL易感性相关[7-8]。有研究对部分位点进行了中国儿童ALL易感性验证,发现位于ARID5B基因的rs10821936和rs10994982与ALL易感性相关[9-10]。前期本课题组根据上述基于欧美人群的两个GWAS报道的儿童ALL易感性位点,结合NCBI数据库亚洲人群中风险等位基因频率,就其中12个SNP位点在191例ALL患儿与191例健康志愿者进行了验证,发现ARID5B基因的rs10821936和rs10994982、ZNF230基因的rs7554607以及IKZF1基因的rs11978267和rs4132601为ALL潜在易感性位点,暂未发现国外GWAS报道的其他SNP位点与ALL发病的相关性[11]。因此,为了排除抽样误差,本课题组在前期研究的基础上,扩大样本量,增加365例病例对这12个SNP位点进行了基因分型,研究这些SNP位点与中国儿童ALL易感性的关系。
白血病疗效是肿瘤细胞、药物以及机体之间相互作用的结果。基于白血病细胞生物学特征的危险度分层(主要是遗传变异分型)为白血病的精准治疗奠定了基础。近年来生殖系细胞的遗传变异对ALL患儿预后影响越来越受到关注。已经发现抗白血病药物的代谢酶GSTM1[12]、DHFR[13]以及转运蛋白ABCC4[14]、ABCB1[15]和儿童ALL预后有关。此外,已经公认ALL细胞的IKZF1基因突变或缺失和预后相关 ......
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