MAGEA3基因表达对亚洲胃癌患者免疫微环境的影响
数据库,血清,1材料和方法,2结果,3讨论
金劲激,蔡一奇,杨佳欣,程骏,王鹏飞温州医科大学附属第一医院 胃肠外科,浙江 温州 325015
胃癌在全球癌症相关死亡原因中排名第四,也是排名第五的常见癌种[1],其发病率有明显的地域差异,近60%的胃癌发生在东亚[2],而东亚也是全球胃癌相关病死率最高的地区。此外,研究表明,亚裔美国人的胃癌发病率高于非西班牙裔白人[3-4],这表明亚裔胃癌不仅与生活方式和文化有关,还与遗传有关。但亚洲胃癌患者较其他地区的胃癌患者有更好的预后,这可能得益于胃癌的早期筛查工作和积极的治疗[5]。由于胃癌的预后不仅取决于肿瘤分期,还取决于肿瘤的异质性和表观遗传分子特征[6],而胃癌不同种族群体之间存活差异的可能原因尚未阐明,因此探索亚洲胃癌患者的发病机制将为胃癌患者的预后预测和治疗提供新的思路。
MAGEA3(melanoma-associated antigen A3)是最常见也是研究最多的肿瘤睾丸抗原(cancertestis antigen, CTA)之一。它在正常组织中不表达,但在许多肿瘤中特异性高表达[7]。我们的前期研究通过分析TCGA(the Cancer Genome Atlas)数据发现MAGEA3可以显著影响胃癌患者的免疫调控,并促进胃癌患者的淋巴结转移[8]。但TCGA是美国国立卫生研究院发起的一个针对全球的癌症基因组研究项目,患者构成以美国人群为主,故TCGA的分析结果不一定适用亚洲人群。而亚洲肿瘤研究组(the Asian Cancer Research Group, ACRG)是由亚洲地区的实验室和研究人员组成的一个合作组织,主要致力于研究亚洲地区的癌症发生、发展和治疗,通过对该数据库的数据分析可反映MAGEA3对亚洲胃癌患者的免疫调控影响。因此,本研究通过分析ACRG中的GSE52254数据集,探讨MAGEA3对亚洲胃癌患者免疫微环境及免疫调节的影响,并进一步通过收集临床胃癌患者血清进行了验证。
1 材料和方法
1.1 数据准备 从GEO数据库(GEO:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/)中下载GSE52254/ACRG数据集,其中共有300例亚洲胃癌患者基因信息及临床信息。根据MAGEA3基因表达值的中位数(1.012),将胃癌患者分为MAGEA3 高表达组(150 例)和MAGEA3低表达组(150例)。从TCGA数据库(https://genome-cancer.ucsc.edu/)中下载375例胃癌患者信息,同样根据MAGEA3表达值的中位数将患者分为MAGEA3高表达组(188例)和MAGEA3低表达组(187例) ......
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