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编号:1479696
长链非编码RNA在青少年特发性脊柱侧凸中的表达研究
http://www.100md.com 2014年4月7日 中华骨与关节外科杂志 2014年第3期
基因芯片,1资料与方法,2结果,3讨论
     刘晓阳 邱贵兴 翁习生 吴志宏 于斌 王以朋

    (中国医学科学院 北京协和医学院 北京协和医院骨科,北京 100730)

    长链非编码RNA在青少年特发性脊柱侧凸中的表达研究

    刘晓阳 邱贵兴 翁习生 吴志宏 于斌 王以朋*

    (中国医学科学院 北京协和医学院 北京协和医院骨科,北京 100730)

    背景:长链非编码 RNA(lncRNAs)是真核细胞中 一类长度 超过 200 核苷酸的非编码 RNA 分子,与人类众多疾病的发生有密切的关系。然而,lncRNAs在青少年特发性脊柱侧凸(AIS)的表达情况尚不清楚。

    目的:利用基因芯片筛选AIS患者外周血中差异表达的lncRNAs和mRNAs,分析lncRNAs在 AIS发病中的可能作用。

    方法:选取 2013 年北京协和医院就诊的 20 例 AIS 患者和 20 例正常对照。利用 Agilent human lncRNA+mRNAArray V3.0 微阵列芯片检测 4 例 AIS 患 者和 4 例年龄匹配的正常对照的 lncRNAs和 mRNAs表达,对差异表达的 mRNAs进行GO、Pathway 分析,构建 lncRNAs和 mRNAs的共表达网络,预测 lncRNAs的可能调控靶点。

    结果:AIS 患者中差异表达的 lncRNAs有 139 条,差异表达的 mRNAs有 546 条。GO 分析发现,差异表达的 mRNAs产物主要参与蛋白结合、金属离子结合、核苷酸结合、调节转录、RNA剪切等。差异表达的mRNAs主要参与细胞黏附分子、Wnt通路、Toll样受体通路、MAPK 通路等。靶基因预测,7 条 lncRNAs可能通过调节 mRNAs的表达参与了 AIS的发病。结论 :本研 究发 现了 AIS 患 者外 周 血 中 差 异 表 达 的 lncRNAs 和 mRNAs。lncRNAs可能 通过 调控 mRNA 的 表 达 参 与AIS的发病或发展。

    特发性脊柱侧凸;青少年;长链非编码RNA

    Background:Long noncoding RNAs(lncRNAs)are broadly classified as transcripts longer than 200 nucleotides,which function in a wide range of diseases.Expression profile of lncRNAs inAIS was still unclear.

    Objective:To detect differentially expressed lncRNAs and mRNAs in peripheral blood samples from AIS patients using microarray and explore the role of lncRNAin the pathogenesis ofAIS. ......

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