后纵韧带骨化症患者基因变异及表型分析
杂合,磷酸酶,1资料与方法,1一般资料,2基因组DNA提取,3WES,4生物信息学分析,5ENPP1基因变异患者临床表型分析,2结果,1WES结果,2变异致病性分析,32例ENPP1基因变异患者临床表型与实验室检查,3讨论
陈欣,张立,周非非,赵衍斌,刁垠泽,潘胜发,王少波,张凤山,孙宇后纵韧带骨化症(ossification of the posterior longitudinal ligament, OPLL)是以后纵韧带异常增生并骨化为特点的疾病,可压迫神经根导致严重的神经功能障碍甚至高位截瘫。中国人颈椎OPLL 和胸椎OPLL 的患病率分别为4.1%和2.25%[1]。流行病学和家系研究均表明遗传因素参与OPLL 的发生与发展[2]。陈振等[3]也发现颈椎OPLL 家族聚集性人群OPLL 发生率较普通人群明显升高,提示遗传因素在颈椎OPLL发生机制中占重要地位[3]。虽然利用全基因组关联分析(genome wide association study,GWAS)[4]、连锁分析和病例-对照相关性研究[5]已发现多个与OPLL 相关的基因/基因座,但其中仅有Enpp1基因纯合缺陷小鼠[6-7]出现了类似于人类OPLL 的表型。有报道ENPP1基因变异可导致全身性婴儿动脉钙化(OMIM:#208000)和低磷血症性佝偻病(OMIM:#613312),其中个别病例伴有OPLL 的发生,呈常染色体隐性遗传[8]。然而,最近有报道ENPP1单等位基因变异也可导致OPLL 的发生[9]。本研究通过对OPLL 患者进行全外显子组测序(whole exome sequencing, WES),明确其可能的致病原因。
1 资料与方法
1.1 一般资料
纳入标准:①经临床症状、体格检查及脊柱正侧位X 线片诊断为OPLL;②签署知情同意书。排除标准:①正在参加其他干预性临床试验者;②有精神障碍或认知障碍者;③内分泌系统疾病患者;④心肺疾病患者;⑤神经系统疾病患者;⑥严重的肝肾疾病、肿瘤患者。
2017年1月至2019年12月北京大学第三医院收治OPLL 患者125 例,依据上述纳入与排除标准选取93 例患者进行WES。其中男56 例,女37 例,年龄33~75岁,平均(52.1±11.0)岁。
本研究经北京大学第三医院伦理委员会审批通过(IRB00006761-2015029),所有患者均签署知情同意书。
1.2 基因组DNA提取
取患者EDTA 抗凝外周静脉血2 mL,采用QIAamp 全血DNA 提取试剂盒(德国Qiagen 公司)提取基因组DNA。
1.3 WES
将基因组DNA 打断、纯化,使用Agilent SureSelect Human All Exome V6 试剂盒(加拿大Agilent Technologies公司)进行全基因组外显子捕获 ......
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