李亚晶，陈 雷，李明轩，王华伟，邓洪儒

    首都医科大学附属复兴医院血管外科，北京 100045

    静脉血栓栓塞症是常见的心血管疾病，包括深静脉血栓形成和肺栓塞(pulmonary embolism，PE)，其影响着多达5%的患者[1]。由于检测手段和技术的提高，虽然PE的住院率呈上升趋势，但病死率保持稳定或呈下降趋势[2-3]。下肢深静脉血栓形成后的血栓脱落并堵塞肺动脉是PE发生的常见机制。中医药在心血管疾病的防治方面具有丰富的经验并取得了良好的效果，在缩短治疗时间、控制病情进展、减少相关并发症等方面充分显示出独特的优势。网络药理学根据系统生物学理论，使用生物信息学和网络分析的方法对生物系统进行分析，其在中医药领域的应用主要强调对信号通路的多途径调节[4]。通过网络药理学可以发现所有生物活性成分或单药治疗疾病的靶点、功能和机制。丹参酮ⅡA是从丹参中分离得到的主要活性化合物，具有保护心脏、抗动脉粥样硬化、抗血栓形成、抗肿瘤、抗菌和抗病毒等多种生物活性[5]。本研究运用网络药理学和分子对接的技术，构建可视化网络，探讨丹参酮ⅡA治疗PE的分析机制，揭示其相关生物学靶点和信号通路，为临床用药提供参考，现报道如下。

    1 资料与方法

    1.1 丹参酮ⅡA相关靶点筛选

    通过中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine systems pharmacology database and analysis platform，TCMSP)数据库[6]以“Tanshinone ⅡA”为关键词，设置条件为“Chemical name”搜索丹参酮ⅡA的相关靶点。从PubChem数据库[7]获取丹参酮ⅡA的分子结构，以SDF格式存储其三维结构，然后将SDF文件上传至PharmMapper数据库[8]和Swiss Target Prediction数据库[9]，获得丹参酮ⅡA的相关靶点。从Uniprot蛋白质数据库[10]中获得人类基因信息，通过对比人类基因信息，将相关数据库中获得的蛋白名称翻译成相应的基因名称，获得最终的丹参酮ⅡA相关靶点。

    1.2 PE相关靶点筛选

    通过GeneCards数据库、人类在线孟德尔遗传数据库(online Mendelian inheritance in man，OMIM)、治疗目标数据库(therapeutic target database，TTD)、DrugBank数据库、DisGeNET数据库、药物遗传学和药物基因组学知识数据库(pharmacogenetics and pharmacogenomics knowledge base ......