李 斌，刘 寿，杜文琪，汪海静，苏效东，文国颖，梁 军，王兆芬

    (青海大学医学院公共卫生系，810001 西宁)

    RD105缺失基因检测法在结核分枝杆菌分型中的应用※

    李 斌，刘 寿，杜文琪，汪海静，苏效东，文国颖，梁 军，王兆芬*

    (青海大学医学院公共卫生系，810001 西宁)

    目的 探讨RD105缺失基因检测法在结核分枝杆菌分型中的应用。方法 133株结核分枝杆菌分别采用Spoligotyping分型法和RD105基因缺失法鉴别北京基因型。结果 133株结核分枝中114株为北京基因型，占85.7%，19株为非北京基因型，占14.3%，经RD105缺失基因检测133株结核分枝杆菌临床分离株中，115株为北京基因型，占86.4%，18株为非北京基因型，占13.6%，Spoligotyping基因分型法与RD105缺失基因检测法比较差异无统计学意义(χ2=0.333，P=0.563)，RD105缺失基因检测法的灵敏度为99.1%，特异度为89.5%，阳性预测值为98.3%，阴性预测值为94.4%。ROC曲线下面积为0.943。结论 RD105基因缺失法检测可以替代Spoligotyping基因分型法。

    结核分枝杆菌 RD105 Spoligotyping ROC曲线下面积

    随着分子生物学技术的不断发展，结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis，MTB)基因型分型技术在该病的流行病学研究中起到了重要的作用，通过对MTB的分型可以判断出该区域流型菌株的类型、病例与病例之间的关系等。MTB中有一组具有相似遗传特征的北京型基因(Beijing genotype)。之前有研究表明青海省流行菌株为北京基因型[1]。北京基因型菌株是一类源于共同祖先的后代菌株，自1995年有van Soolingen等首次报道以来，全球已发现该菌株的流行，在亚洲地区该菌株为主要流行菌株。近年来随着研究深入，研究者发现在北京基因型中RD105存在缺失区域，提出了RD105可以作为北京基因型菌株的分子标志物[2]。本研究采用基于PCR法的RD105缺失检测法和间隔区寡核苷酸分型方法(spacer oligonucleotide typing，Spoligotyping)对青海省133株结核分枝杆菌临床分离株进行基因分型，探讨RD105基因缺失检测法在结核分枝杆菌基因分型中的运用。

    1 材料与方法

    1.1 菌株

    133株结核分枝杆菌临床分离株和对照标准菌株H37Rv由青海省疾病预防控制中心传染病预防控制所结核病实验室提供 ......