青海地区藏族HIF-2α基因单核苷酸多态性与胃癌易感性※
分型,基因型,1资料与方法,1组织标本,2主要仪器与试剂,3实验方法,4统计学方法,2结果,1基因组DNA电泳检测结果,2PCR产物检测结果,3测序结果,4基因型和基因频率在两组中的分布结果,3讨论
马金华,王丽娟,李进章,马金兰,骆玉霜,沈存芳,马金祥,李 豪,徐晓宁(1.青海大学附属医院肿瘤内科,青海 西宁 810001;2.青海大学附属医院肾病内科,青海 西宁 810001;3.青海大学医学院,青海 西宁 810001)
青海地区位于青藏高原,胃癌属该地高发肿瘤[1-2]。缺氧诱导因子(hypoxia-inducible factors,HIFs)是参与缺氧应答的转录因子家族之一,可以对多种基因的表达进行调控,并介导某些病理过程[3-4]。现有研究证实HIF-1SNP与胃癌发病相关,HIF-2α单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)与胃癌是否相关未见报道。本研究在基因水平检测藏族健康者及胃癌患者血液HIF-2αSNP,分析两者在胃癌发生发展中可能存在的相关性。
1 资料与方法
1.1 组织标本
在青海大学附属医院、青海省人民医院、青海省藏医院,收集2014年11月~2016年12月体检的世居青海的藏族健康者外周血62例作为对照组、45例胃癌患者外周血作为胃癌组。胃癌组男性29例,女性16例;年龄为20~79岁,平均年龄为(48.26±7.32)岁;所有患者病理分型皆为腺癌。对照组男性38例,女性24例;年龄为22~83岁,平均年龄为(46.45±6.51)岁;所有患者病理分型皆为腺癌。一般资料具有可比性(P<0.05)。本课题经过青海大学附属医院医院伦理委员会批准。
1.2 主要仪器与试剂
1.2.1 仪器
PCR扩增仪(Verity 96well,美国 ABI),凝胶成像仪(Gene Genius,英国Syngene),3730XL测序仪(美国 ABI)。
1.2.2 试剂
DNA marker(加拿大 BBI公司),基因组DNA提取试剂盒、PCR扩增试剂盒(上海生工生物工程有限公司)
1.3 实验方法
1.3.1 血样标本收集
空腹静脉采集胃癌组和对照组成员外周血,作EDTA抗凝处理。
1.3.2 基因组DNA提取
取上述血液样品,严格按照上海生工生物工程有限公司的血液基因组DNA提取试剂盒要求提取DNA,用0.8%的琼脂糖凝胶电泳检测完整度,用NanoDrop 2000分光光度计测其含量及纯度后保存于-20 ℃冰箱备用。
1.3.3 引物设计和合成
通过美国国家生物信息中心(NCBI)的GenBanb获取HIF-2α基因序列及其相应位点的SNP信息 ......
您现在查看是摘要页,全文长 9964 字符。