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编号:1279563
青海地区藏族HIF-2α基因单核苷酸多态性与胃癌易感性※
http://www.100md.com 2018年9月28日 中国高原医学与生物学杂志 2018年第3期
分型,基因型,1资料与方法,1组织标本,2主要仪器与试剂,3实验方法,4统计学方法,2结果,1基因组DNA电泳检测结果,2PCR产物检测结果,3测序结果,4基因型和基因频率在两组中的分布结果,3讨论
     马金华,王丽娟,李进章,马金兰,骆玉霜,沈存芳,马金祥,李 豪,徐晓宁

    (1.青海大学附属医院肿瘤内科,青海 西宁 810001;2.青海大学附属医院肾病内科,青海 西宁 810001;3.青海大学医学院,青海 西宁 810001)

    青海地区位于青藏高原,胃癌属该地高发肿瘤[1-2]。缺氧诱导因子(hypoxia-inducible factors,HIFs)是参与缺氧应答的转录因子家族之一,可以对多种基因的表达进行调控,并介导某些病理过程[3-4]。现有研究证实HIF-1SNP与胃癌发病相关,HIF-2α单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)与胃癌是否相关未见报道。本研究在基因水平检测藏族健康者及胃癌患者血液HIF-2αSNP,分析两者在胃癌发生发展中可能存在的相关性。

    1 资料与方法

    1.1 组织标本

    在青海大学附属医院、青海省人民医院、青海省藏医院,收集2014年11月~2016年12月体检的世居青海的藏族健康者外周血62例作为对照组、45例胃癌患者外周血作为胃癌组。胃癌组男性29例,女性16例;年龄为20~79岁,平均年龄为(48.26±7.32)岁;所有患者病理分型皆为腺癌。对照组男性38例,女性24例;年龄为22~83岁,平均年龄为(46.45±6.51)岁;所有患者病理分型皆为腺癌。一般资料具有可比性(P<0.05)。本课题经过青海大学附属医院医院伦理委员会批准。

    1.2 主要仪器与试剂

    1.2.1 仪器

    PCR扩增仪(Verity 96well,美国 ABI),凝胶成像仪(Gene Genius,英国Syngene),3730XL测序仪(美国 ABI)。

    1.2.2 试剂

    DNA marker(加拿大 BBI公司),基因组DNA提取试剂盒、PCR扩增试剂盒(上海生工生物工程有限公司)

    1.3 实验方法

    1.3.1 血样标本收集

    空腹静脉采集胃癌组和对照组成员外周血,作EDTA抗凝处理。

    1.3.2 基因组DNA提取

    取上述血液样品,严格按照上海生工生物工程有限公司的血液基因组DNA提取试剂盒要求提取DNA,用0.8%的琼脂糖凝胶电泳检测完整度,用NanoDrop 2000分光光度计测其含量及纯度后保存于-20 ℃冰箱备用。

    1.3.3 引物设计和合成

    通过美国国家生物信息中心(NCBI)的GenBanb获取HIF-2α基因序列及其相应位点的SNP信息 ......

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