Halomonas sp.QHL1四氢嘧啶合成基因簇ectABC与上游调控序列的克隆及其功能分析※
质粒,1材料与方法,1实验材料,2实验方法,2结果与分析,1ectABC基因簇及其上游启动子序列的克隆,2重组表达质粒的构建,3QHL1ectABC基因簇及其上
石 晴,朱德锐(青海大学医学院 基础医学研究中心 西宁 810016)
四氢嘧啶[Ectoine:(4S)-2-methyl-1,4,5,6-tetrahydropyrimidine-4-carboxylic acid]是一类嗜盐或耐盐菌胞内合成的主要相容溶质,是用于抵抗高盐环境的一种重要物质[1]。其结构属氨基酸环化衍生物或部分氢化嘧啶衍生物[2],具有分子手性,化学方法难以合成[3]。在生化特性方面,Ectoine具有惰性、胞内高耐受性、热稳定性和水溶性等特点[2],影响细胞在逆境环境中的渗透压调节功能,可提高细胞在高盐、干旱和低温等恶劣环境中的适应性。Ectoine作为微生物重要的次级代谢产物,已广泛应用于生物医学领域[4-7]。
近年来,Ectoine的生物合成途径从基因水平、酶水平和调控水平等方面已有较为深入的研究。用ectA、ectB和ectC3个基因分别编码的L-2,4-二氨基丁酸乙酰转移酶(Ect A)、L-2,4-二氨基丁酸转氨酶(Ect B)和Ectoine合成酶(Ect C)调控Ectoine的生物合成[8]:首先,以L-天冬氨酸-β半醛(ASA)为底物在Ect B催化作用下生成L-2,4-二氨基丁酸(DABA);其次,Ect A将DABA乙酰化生成N-乙酰-L-2,4-二氨基丁酸(ADABA);最后,将ADABA催化生成四氢嘧啶。基于此,克隆及异源表达Ectoine合成基因簇及其上游调控序列,用于阐明在盐激条件下何种调节蛋白或因子参与Ectoine合成基因簇ectABC操纵子的启动应答的分子机制。本研究以Halomonassp.QHL1为模式菌株,克隆ectABC基因簇及其上游调控序列,并对其在E.coilBL21中的蛋白表达及耐盐能力进行检测。
1 材料与方法
1.1 实验材料
Halomonassp.QHL1菌株分离自青海湖水体;菌株E.coilDH5α和E.coilBL21(DE3)由青海大学医学院基础医学研究中心提供;细菌基因组DNA提取试剂盒、质粒小提试剂盒(离心柱)和GeneGreen核酸染料购自北京天根生化科技有限公司;克隆载体pMD18-T、表达载体pColdⅠDNA、T4 DNA连接酶和限制性内切酶购自大连TaKaRa公司;DL 5000 Maker购自广东东盛生物科技有限公司;AxyPrep DNA凝胶回收试剂盒购自杭州爱思进生物技术有限公司 ......
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