李超群,张发斌,赵 婧,李凤辉,高瑞雪,樊海宁

    (1.青海大学医学院;2.青海大学附属医院;3.青海省包虫病研究重点实验室)

    目前,疫苗因具有安全、无残留、动物无休药期的优点在棘球蚴病的防治中得到广泛地研究、应用[1]。预测抗原表位有助于了解抗体抗原识别的免疫基础,有助于疫苗设计和药物研发[2]。

    本研究通过相关课题设计,对细粒棘球绦虫肌动蛋白(Echinococcus granulosus actin Eg ACT)的结构和抗原表位进行分析,为筛选疫苗候选抗原提供依据。

    1 研究方法

    1.1 氨基酸序列获取

    通过GenBank数据库查寻下载细粒棘球绦虫肌动蛋白的氨基酸序列,登录号为EUB56817.1。

    1.2 蛋白质特性预测

    利用Expasy线上分析系统(https：//web.expasy.org/protparam/)的protparam数据库预测细粒棘球绦虫肌动蛋白的等电点、相对分子量、稳定性等理化性质,利用Expasy系统的protscale数据库预测亲/疏水区域。利用SignalP-5.0 Server(http：//www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/)和 TMHMM(http：//www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM/)软件确定蛋白质信号肽序列与跨膜结构区域,利用DNAstar Protean线下软件分析蛋白的亲水性、柔性区域、抗原指数及表面可及性 ......