藏药沙棘防治高原红细胞增多症作用机制的网络药理学研究※
靶点,通路,数据库与方法,1数据库,2方法,结果,1化合物筛选及靶点预测,2PPI网络构建,3基因本体(GO)富集分析及KEGG通路分析,4网络构建,讨论
李田田,刘 芳,王淑琼,付成冰(青海大学医学院,青海 西宁 810001)
藏医药经典著作《晶珠本草》记载沙棘“化血并治培根病”[1],广泛应用于高原红细胞增多症(High Altitude Polycythemia,HAPC)的防治。现代医学研究发现沙棘具有抗氧化、清除ROS、增强机体免疫力等功能[2]。由于沙棘的化学成分复杂,其功能多样致作用机制不明。
网络药理学能够通过构建、分析药物成分-靶点-疾病的网络关系,系统地阐释药物治疗疾病的作用机制,非常适合研究此类传统药物[3]。本研究采用网络药理学的思路方法,筛选沙棘防治HAPC的有效成分,系统地分析其防治HAPC的靶点及通路,为阐明沙棘防治HAPC的作用机制提供参考。
1.数据库与方法
1.1 数据库
TCMSP数据库(http://www.tcmspw.com);PharmMapper服务器(http://www.lilab-ecust.cn/pharmmapper/);UniProt 数据库(https://www.uniprot.org/);DrugBank 数据库(https://www.drugbank.ca/);David 6.8软件(http://david.ncifcrf.gov);KEGG数据库(http://www.Genome.jp/kegg);String数据库(http://string-db.org) 。
1.2 方法
1.2.1 沙棘成分的筛选
进入TCMSP数据库,在搜索栏输入“沙棘”,设置参数DL(药物相似度)≥30%、OB(口服生物利用度)≥0.18筛选获取“沙棘活性成分”的文献资料 ......
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