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编号:1272784
西宁地区汉族人群TBX5突变与先天性心脏病的相关性※
http://www.100md.com 2020年5月25日 中国高原医学与生物学杂志 2020年第4期
外显子,对象与方法,1研究对象选择,2样本收集与DNA提取,3外显子PCR和测序,4统计学分析,结果,1哈迪-温伯格遗传平衡检验结果,28个外显子部分PCR产物电泳结果,3突变位点测序峰图,讨论
     张 辉,李爽林,马 强,杨应忠,李 琳

    (1.青海大学医学院,青海 西宁 810001;2.青海大学附属医院,青海 西宁 810001;3.青海大学研究生院,青海 西宁 810016)

    先天性心脏病(Congenital heart disease,CHD)是由遗传因素和环境因素单独或两者共同作用引起的。西宁属高海拔地区,CHD的总患病率为1.15%,明显高于我国平原地区(0.13%~0.35%)[1]。徐等[2]的调查显示,青海省CHD的发生率高于国内平原地区,并且随海拔的升高,CHD检出率增高。TBX5是影响心脏发育的重要影响因子之一,其位于染色体12q24区,是T-box转录因子家族的成员,具有8个外显子,可编码518个氨基酸[3]。本研究通过对研究对象TBX5的所有外显子进行测序和分析,探讨TBX5突变与西宁地区汉族人群先天性心脏病的相关性。

    1.对象与方法

    1.1 研究对象选择

    收集2016年至2019年就诊于青海大学附属医院的220例西宁地区的汉族CHD患者及220名健康者血液。本次研究通过青海大学医学院伦理审查委员会审查,并与所有研究对象签署知情同意书。

    1.2 样本收集与DNA提取

    抽取受试者外周静脉血5 mL于EDTA抗凝管中,并用Gentra Puregene Blood Kit血液基因组提取试剂盒(Qiagen,158389,德国)提取基因组DNA。用DU800核酸检测仪测定DNA浓度,最终将样品基因组DNA稀释至200 ng/μL后置-20 ℃冰箱保存。

    1.3 外显子PCR和测序

    通过Primer3.0(version0.4.0)软件为TBX5(NG_007373.1)8个外显子设计引物(表1) ......

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