梁沛余，马晓雨，常秀君，韩蕙竹，夏晓晓，解安达，吴 穹#

    (1.青海大学医学院，青海 西宁 810001；2.武汉大学基础医学院，湖北 武汉 430000)

    目前影响低级别胶质瘤(Low-grade gliomas，LGG)预后的因素不明。有研究显示，仅存在癫痫表现的LGG患者相比于其他临床表现患者具有更高的存活率，术前存在癫痫史患者相比于无癫痫史患者具有更好的临床预后结果[1-2]，说明癫痫史可能是影响临床预后的重要因素。对于此现象，有学者从行为决策角度认为癫痫的发作可能会促进患者早期就医而及时获得相关治疗，而头痛、感觉异常等其他神经表现易被忽视[3]。本课题组从肿瘤病理生理角度推测，癫痫史对LGG预后的影响可能依赖于脑肿瘤独特的分子生物学基础，但目前癫痫相关基因在LGG预后中的作用尚不清楚。本研究拟利用生物信息学高通量筛选LGG相关癫痫基因，并通过联合多数据库分析关键癫痫基因对LGG患者预后的影响，并初步探讨其可能作用机理。

    1.资料与方法

    1.1 资料

    GSE32534基因芯片数据[4]获取于NCBI-GEO数据库，是基于GPL570平台的[HG-U133_Plus_2]Affymetrix Human Genome U133 Plus 2.0 Array转录本，种属为人源，芯片样本信息共计10例，其中LGG伴有癫痫样本5例(2例星形细胞瘤，2例神经节神经胶质瘤，1例少突神经胶质瘤)、LGG无癫痫样本5例(1例星形细胞瘤，3例神经节神经胶质瘤，1例少突神经胶质瘤)。本研究选用全部芯片结果。

    1.2 方法

    1.2.1 LGG癫痫相关基因筛选

    用GEO2R算法比对筛选差异基因，以P1.5为差异基因筛选标准；下载NCBI-gene、DisGeNET、GeneCards数据库癫痫基因，获取多数据库人癫痫共有基因；将芯片差异基因与多数据库人癫痫共有基因比对，用Bioinformatics & Evolutionary Genomics软件在线绘制Venn图，得到最终的LGG癫痫相关基因。

    1.2.2 基因本体论(Gene ontology ......