NF2、EZR和p53基因甲基化与青海汉族、撒拉族、回族胃癌易感关系※
1对象与方法,1研究对象,2试剂与仪器,3研究方法,2结果,1青海汉,回族胃癌及正常胃组织NF2基因甲基化结果,2青海汉,回族胃癌及正常胃组织EZR基因甲基化结果,3青海汉,回族胃癌及正常
赵 婧,马 美,刘博学,陈思嫒,孙静薇,苏占海(青海大学医学院,西宁 810001)
我国胃癌分布呈现区域聚集性特征,青海地区汉族、撒拉族、回族发病率高于东南沿海地区。目前研究结果表明胃癌的发生与抑癌基因APC、p15、p16等的异常甲基化有关[1-3]。青海汉族、撒拉族、回族胃癌高发是否与NF2、EZR和p53甲基化异常相关,本研究采用基因组学法开展相关研究。
1 对象与方法
1.1 研究对象
经青海大学医学院伦理委员会批准,从青海大学附属医院、青海省人民医院、青海红十字医院收集汉族、撒拉族、回族胃癌患者胃癌组织标本各30例组成病例组、健康体检者胃组织标本各20例组成对照组。
1.2 试剂与仪器
DP318-02血液基因组DNA提取试剂盒(北京天根公司,中国),PCR产物回收试剂盒(上海生工公司,中国);琼脂糖(上海生工公司,中国),亚硫酸氢盐(上海生工公司,中国);恒温水浴锅(江苏金坛公司,中国),低温冷冻离心机(艾本德生命科学公司,德国),核酸蛋白浓度检测仪(基因有限公司,美国),DYY-6C琼脂糖电泳仪(北京六一公司,中国),凝胶成像仪(耶拿公司,德国),PCR仪(伯乐生命医学产品有限公司,美国)。
1.3 研究方法
1.3.1 组织DNA提取及浓度、纯度的测定
按照试剂盒说明书称取30 mg组织剪碎于离心管中,加入100 μL GA,用匀浆器匀浆,之后再加入100 μL GA,轻柔吹打使其均匀悬浮,提取组织中的DNA。取1 μL TE滴加于核酸蛋白浓度检测仪进行调零,滴加1 μL DNA样品检测其浓度,并记录A260/A280值,该值在1.8~2.0之间提示DNA纯度较高。
做完电泳(1%琼脂糖凝胶)后在紫外灯下验证DNA的完整性。
1.3.2 DNA修饰
用亚硫酸氢盐修饰DNA。
取DNA样品2 μg于1.5 mL离心管中,加纯水定容至50 μL,每管加入5.5 μL新配制的氢氧化钠溶液(3.0mol/L)进行水浴(42℃,30min) ......
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