广东和山东地区鼻咽癌组织EB病毒BART miRNAcluster 1多态性比较
广东地区,变异型,1材料与方法,1研究对象,2BARTmiRNAcluster1基因序列分析,3系统进化树分析,4统计学分析,2结果,1BARTmiRNAcluster1基因序列
高龙峰,王巧祎,张增霞,王云(青岛大学,山东 青岛 266071 1 基础医学院病原生物学系; 2 附属心血管病医院检验科)
EB病毒(EBV)在人群中普遍感染,但鼻咽癌(NPC)、Burkitt’s淋巴瘤和结外NK/T细胞淋巴瘤等EBV相关肿瘤的发病呈明显的地域性分布[1-3],其中NPC只在中国南方部分地区(广东、香港、广西和湖南等)和东南亚高发[1]。造成EBV相关肿瘤地域性分布的原因尚不明确,可能与病毒、遗传和环境等多种因素相关[1-3]。是否存在与EBV相关肿瘤发生及地域性分布相关的EBV基因变异是肿瘤病因学研究的热点。以往研究多针对EBV编码蛋白的基因进行[4-7],较少关注其非编码基因。EBV是第一个被确认编码微小RNA(miRNA)的人类病毒,共编码44个成熟的miRNA,其中40个由BamHⅠ A右向转录产物(BART)生成。BART区域又分为cluster 1和cluster 2两个区域,其中cluster 1区域包含8个miRNA前体和14个成熟miRNA,cluster 2区域包含有14个miRNA前体和26个成熟miRNA[8-9]。研究表明,BART miRNA在病毒持续性感染和肿瘤发生发展过程中起重要作用[9-11]。最近有研究对BART miRNA启动子区域和BART miRNA cluster 2区域进行了序列分析,发现这些基因也存在变异,且某些变异可能与肿瘤相关[12-14],但目前尚无对cluster 1区域基因多态性分析的报道。本研究检测广东地区(NPC高发区)和山东地区(NPC低发区)NPC和健康人群中BART cluster 1基因变异情况,探讨该基因变异与NPC的关系,以期为揭示EBV基因变异在肿瘤发生中的作用提供依据。
1 材料与方法
1.1 研究对象
广东地区样本取自中山医科大学第一附属医院和第三附属医院,山东地区样本取自青岛大学附属医院。NPC样本为经病理学检查确诊的石蜡包埋组织;健康人群样本为取自健康查体人员的咽漱液,其性别及年龄与NPC病人匹配且排除肿瘤病史。石蜡包埋组织和咽漱液标本DNA提取和EBV阳性标本鉴定的具体方法和步骤见文献[15]。对EBV阳性标本进行BART miRNA cluster 1序列测定,成功获得序列的296例样本纳入本研究。其中广东地区NPC病人79例,男58例,女21例,年龄26~69岁,平均(48.63±10.61)岁;健康人群59例,男45例,女14例,年龄27~69岁,平均(49.41±9.85)岁 ......
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