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编号:1083699
琼脂糖电泳中核酸染料Goldview最佳使用方案的建立
http://www.100md.com 2012年11月14日 遵义医科大学学报 2012年第4期
凝胶电泳,条带,1材料与方法,2结果,3讨论
     王 燕,彭莉萍,罗镇明

    (遵义医学院珠海校区 生物化学与细胞分子生物学教研室,广东 珠海 519041)

    琼脂糖电泳中核酸染料Goldview最佳使用方案的建立

    王 燕,彭莉萍,罗镇明

    (遵义医学院珠海校区 生物化学与细胞分子生物学教研室,广东 珠海 519041)

    目的确定琼脂糖凝胶电泳中使用核酸染料Goldview的最佳浓度和方法,尽可能减少实验中Goldview用量,控制其对实验室环境的污染。方法配置含不同浓度Goldview的上样缓冲液,混合不同浓度 DNA溶液的琼脂糖凝胶电泳,然后对比预染样品法、前染法及后染法的染色效果。结果实验结果显示上样缓冲液中含0.4% Goldview的预染样品法电泳检测核酸的效果最佳且能检测的核酸样品浓度在16.5ng或以上为最佳。结论核酸染料Goldview在核酸的琼脂糖凝胶电泳中使用的最佳方案为预染样品法,实验中推荐浓度达到普通实验要求,并且最易控制对周围环境的污染。

    琼脂糖凝胶电泳;核酸染料;Goldview

    目前实验室中所用的核酸染料主要有EB(溴化乙啶)、SYBR Green I和Goldview等。作为核酸染料它们对人体都存在一定程度的危害。EB作为一种常规的核酸染料曾广泛的被应用于琼脂糖凝胶[1]和聚丙烯酰胺凝胶[2]中DNA与RNA的观察和检测,但EB是一种诱变剂,可插入核酸相邻碱基平面之间,引起基因突变,具有中等毒性,对人体有潜在的危害性[3]。SYBR Green I是近些年新推出的一种荧光核酸染料,因其危害性较低而逐渐成为EB的替代品之一[4],但ssDNA的检测灵敏度不高,效果不好,应用于DNA凝胶电泳中稳定性不高。目前琼脂糖凝胶电泳中Goldview已被广泛使用,其染色效果和灵敏度与EB相近,且未证实有致癌性[5],是EB较理想的替代品。但它穿透能力强,对眼睛和皮肤有明显的刺激性。实验中由于Goldview的用量过大或实验员的不慎,导致桌面、扶手、门锁等多处被污染。实验室中使用Goldview进行染色的方法主要有前染法和后染法[6],但在以往的实验中曾发现预染样品法信噪比高,条带边缘锐利。因此,本实验旨在探索上样缓冲液中Goldview的最佳浓度值 ......

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