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编号:809058
R软件metagen命令在预后研究Meta分析中的应用
http://www.100md.com 2016年12月22日 遵义医科大学学报 2016年第5期
对数,亚组,1软件及程序包的安装和加载,2数据的加载与预处理,3metagen命令进行HR的Meta分析,4metagen命令与rma命令的异同
     金甦晗,周建国,管晓燕,3,梁文红,3 ,刘建国,3

    (1.遵义医学院附属口腔医院 牙体牙髓科, 贵州 遵义 563099;2.遵义医学院附属医院 肿瘤医院,贵州 遵义 563099;3.贵州省高等学校 口腔疾病研究特色重点实验室暨遵义市口腔疾病研究重点实验室,贵州 遵义 563099)

    技术与方法

    R软件metagen命令在预后研究Meta分析中的应用

    金甦晗1,周建国2,管晓燕1,3,梁文红1,3,刘建国1,3

    (1.遵义医学院附属口腔医院 牙体牙髓科, 贵州 遵义 563099;2.遵义医学院附属医院 肿瘤医院,贵州 遵义 563099;3.贵州省高等学校 口腔疾病研究特色重点实验室暨遵义市口腔疾病研究重点实验室,贵州 遵义 563099)

    目的 介绍R软件metagen命令在预后研究Meta分析中HR合并的运用。方法 以实例数据为例,采用R软件metagen命令合并HR,进行预后研究Meta分析。 结果 metagen命令能够进行相关统计学计算及森林图绘制。 结论 metagen命令可作为系统评价制作者处理预后研究Meta分析的较好方法,以弥补R软件其他程序包或命令的不足。

    R软件;metagen命令;预后研究;Meta分析

    预后研究Meta分析是一类定量合并预后相关结局的二次文献分析,主要以合并时间-生存相关数据的危险比(HR)为代表[1]。用于制作该类系统评价的软件主要有Review Manager,STATA等,但仍面临较多局限,如:Review Manager需将HR转化为O-E、V方可使用,STATA为付费软件、需将HR对数化等。随着R软件的传播,由于其具有免费、开源、实时更新等优点,因而受到各界的广泛应用。国内已有相关学者介绍R软件在经典Meta分析[2]、网状Meta分析[3]、剂量-反应Meta分析[4]及诊断性实验Meta分析[5]的运用,但R软件在预后研究Meta分析运用的相关介绍尚未发现。此外,虽然R软件中有专门针对预后研究Meta分析的程序包,读者可通过metafor程序包下的rma命令予以实现,但仍有诸多不足,如:需对结果进行去对数化、制作森林图的命令复杂等。王嘉淇等[6]介绍了metagen命令在Meta分析中的运用,但未详述其在预后研究Meta分析中的运用。现通过实例展示,介绍R软件中meta程序包下的metagen命令在合并HR及制作森林图方面的运用。

    1 软件及程序包的安装和加载

    下载与安装R及RStudio软件参考周建国等[5]的方法 ......

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