基于TCGA挖掘肺腺癌微环境预后相关基因
生存率,基质,1材料与方法,2结果,3讨论
成天琼,陈学农(1.遵义医科大学附属医院 康复医学科,贵州 遵义 563099;2.遵义医科大学附属医院 针灸科,贵州 遵义 563099)
肺癌是最常见和致命的恶性肿瘤之一,每年约有200万新病例和180万人死亡[1]。肺癌通常分为两种组织病理亚型:小细胞肺癌(Small cell lung cancer,SCLC)和非小细胞肺癌(Non-small cell lung cancer,NSCLC),NSCLC占所有肺恶性肿瘤的80%。根据最新统计数据显示男性非小细胞肺癌平均5年生存率为19.2%,女性为26.8%[2]。NSCLC可以进一步分为肺鳞状细胞癌、肺腺癌(Lung adenocarcinoma,LADC)和大细胞癌,而LADC是最常见的肺癌亚型[3],约占NSCLC的50%,且预后不佳。尽管随着外科手术、放射治疗、化学疗法的发展,但大多数患者在诊断时存在局部或广泛转移,5年总生存率(Overall survival,OS)仍不到20%[2,4]。靶向药物和免疫疗法的应用为患者带来新的希望。肿瘤微环境(Tumor microenvironment,TME)即肿瘤所在的细胞环境,具有异质性,TME由免疫细胞、内皮细胞、成纤维细胞和髓样细胞以及炎症介质和细胞外基质分子等组成[5],是导致肿瘤进展和患者高死亡率的关键因素[6]。肺癌的微环境取决于肿瘤细胞与邻近的非癌性基质细胞如内皮细胞、免疫细胞和成纤维细胞之间的复杂相互作用[7]。癌症相关的成纤维细胞诱导肺癌中葡萄糖调节蛋白的表达并促进肺癌进展[8]。在过去十年研究中认识到TME在肺癌发生、发展中的中心作用[2,9-10],原发性和继发性肺肿瘤的TME是开发新型抗癌药物的一个靶标,针对TME的相关药物包括血管内皮生长因子(VEGF)、芳香化酶等已被批准用于临床[4,11]。在TME中,免疫细胞和基质细胞是两种主要的非肿瘤成分,对肿瘤的诊断和预后评估具有重要价值,肿瘤微环境预后相关基因也可能成为下一个新的治疗靶点。
Yoshihara等[12]设计了一种称为ESTIMATE的算法,探讨免疫细胞和基质细胞的浸润程度与肿瘤预后的潜在关系。随后的研究很快将ESTIMATE算法应用于急性白血病[13-14]、胶质细胞瘤[15]、肾透明细胞癌[16-17]、结肠癌[18]和乳腺癌[19],并显示出这种基于大数据算法的有效性。故本研究基于ESTMATE算法探讨免疫细胞和基质细胞的浸润程度与肺腺癌预后的潜在关系,获取可预测肺腺癌患者预后不良的肿瘤微环境相关基因。
1 材料与方法 ......
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