段晨翰，李寿田

    (遵义医科大学 法医学院，贵州 遵义 563099)

    人类基因组DNA测序和分析的研究成果表明，基因组中的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism，SNP)位点含量丰富，分布广泛[1]，尤其在种族推断、表型特征刻画中发挥着特殊的作用，在一些高度降解的检材分析中，是短串联重复序列(short tandem repeat，STR)数据结果的重要补充。近年来，SNP在医学、遗传学、人类学、药物分子研究等方面的迅猛发展，使其受到了法医工作者的高度关注，现将从SNP概述、优缺点、分析技术、群体遗传学参数及法医学应用等方面回顾性综述了国内外相关研究进展，为SNP的法医学应用提供参考。

    1 SNP概述

    单核苷酸多态性(SNP)主要是指在基因组水平上特定部位由单个碱基序列的变异所引起的DNA序列多态性，它是人类可遗传变异中最常见的一种，占所有已知多态性的90%以上[2-4]。其所表现的多态性通常只涉及到单个碱基的变异，多表现为二等位基因，本质上属于DNA序列多态性。研究发现在人类基因组中，SNP的密度很高，多态性丰富，大概每1 000个碱基就包含一个，其在基因组上的总量大概是3 ×106个。因此，SNPs 被认为是继限制性片段长度多态性和微卫星多态性之后的第3代有巨大应用潜力的DNA遗传标记。

    2 SNP的优缺点

    SNP作为潜在的法医学遗传标记最主要的原因是：①SNP的PCR扩增片段可小于100bp，更适合PCR扩增，可用于高度降解的DNA样本；②突变率非常低，SNP的突变率约为10-8，而STR则约为10-3，SNP的低突变率使得其在亲权鉴定中显得十分重要；③检测方法多样，可做高通量技术分析，并在数据库的建立和自动化分析的实现方面具有积极意义[5]；④分型数据中没有人工伪峰，可简化等位基因的分析；⑤SNP大都表现为二等位基因标记，易于分型和确定基因频率， 适于混合样品的分析[6]；⑥有些SNP标记可预测种族来源、系谱信息或表型特征。当然，SNP也有一些局限性。研究表明，至少要5～10倍的SNP 位点才可以达到等效STR基因座的个人识别率和混合样本检测能力，这大大超过了目前法医物证专业的多重扩增能力。其次，由于群体遗传数据和检测技术的缺乏，其商品化试剂盒有待进一步开发。目前，将SNP分型技术用于法医学案件的报导比较少，寻找高信息量的SNP位点，实现同时复合扩增足够的SNP标记，仍是一项艰巨的挑战。作为遗传标记SNP也存在一些缺点，如SNP分型前期投资较大 ......