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编号:808445
贵州汉族人群23个STR基因座的OL等位基因研究
http://www.100md.com 2020年2月5日 遵义医科大学学报 2020年第6期
1材料与方法,2结果,3讨论
     张 昊,胡锡阶,刘祖林,罗 丽,万卫红,陈鹏宇,余丽梅

    (1.遵义医科大学附属医院 贵州省细胞工程重点实验室,贵州 遵义 563099;2.遵义医科大学 法医学院,贵州 遵义 563099;3.遵义医科大学附属医院 司法鉴定中心,贵州 遵义 563099)

    短串联重复序列(Short tandem repeat,STR)是一类长度多态性遗传标记,在人类基因组中分布广泛,核心重复单位数目的变化形成了STR基因座的遗传多态性[1]。STR基因座在不同人群中存在显著的群体遗传结构差异,主要表现在等位基因的数目、分布频率、突变和序列结构特征等方面[2-3]。在法医学实践中,对特定群体的STR基因座进行遗传多态性调查,是应用于该群体个体识别、亲权鉴定以及群体遗传学研究的基本前提。

    OL(Off-Ladder)等位基因是采用国际标准化检测仪器对STR进行等位基因分型时,因所检测的等位基因未被包含在商品化试剂盒等位基因分型标准物(Allelic ladder)中,不能被仪器自动识别和程序化数字命名的等位基因[4]。其来源于群体中发生微变异的等位基因或稀有等位基因,多数情况下是具有群体特征性而之前未报道的新等位基因。目前,国内外多个实验室相继在不同群体或单个STR基因座上检测出OL等位基因[5-7],贵州汉族群体的OL等位基因数据尚缺乏。本研究应用在中国群体中遗传多态性高的Huaxia PlatinumTM试剂盒,对贵州汉族人群23个常染色体STR基因座的OL等位基因进行统计和分析,以期补充和完善贵州汉族群体的遗传多态性数据。并与采用相同检测体系的群体进行OL等位基因及频率比较,进一步探讨OL等位基因在不同群体中的差异性。

    1 材料与方法

    1.1 材料 样本来源于遵义医科大学附属医院法医鉴定中心法医物证室(即贵州省细胞工程重点实验室分子生物学技术室的法医物证室)亲子鉴定的日常检案,随机选取2016~2018年1 291例贵州汉族无关个体血样,其中男性882例,女性409例。

    1.2 主要试剂与仪器 Huaxia PlatinumTM试剂盒、等位基因分型标准物、内标(LIZ600)、POP 4凝胶和缓冲液(ABC、CBC)均为美国ABI公司产品,Veriti 96 well PCR扩增仪和3500-DX遗传分析仪也购于美国ABI公司。

    1.3 方法

    1.3.1 制备FTA血卡 取80 μL血液均匀涂至FTA卡中央区域,室温自然干燥,手动打孔器取下直径约1 mm血斑放入PCR管 ......

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