余春波，李大玉，范 芳，李长福

    (遵义医科大学 生物化学教研室，贵州 遵义 563099)

    肝细胞癌(Hepatocellular carcinoma，HCC)是消化系统最常见的恶性肿瘤之一[1]，其发病率和死亡率占全球癌症的第6位和第4位[2]，病毒感染、酒精、肥胖等都可能引发HCC的发生，尽管在手术治疗、化疗方面取得一些进展，但肝癌发生的分子机制仍然难以捉摸[3]。由于缺乏有效的治疗靶点，一直以来都是临床治疗阶段的一个难关，随着癌症的基因突变和全基因组研究的开展，许多基因在肿瘤的致癌过程中起作用，这可能对开发有效的肝癌预防和治疗方案有用，因此，筛选及鉴定肝癌发生发展过程中的关键基因和通路，将有助于认识肝癌潜在的发病机制，以期为临床寻找更多的诊断方法、治疗靶点和预后提供一定的参考。

    目前，癌症研究已进入基因组学数据测序时代，将更好地了解癌症基因变化，确定潜在的基因突变，进一步发现新的治疗靶点[4]，单张数据芯片分析的结果，假阳性率相对较高。本研究从GEO数据库中筛选下载五个数据集，通过对正常肝组织和HCC组织基因芯片中的差异基因进行分析，筛选得到关键基因和信号通路；进一步验证关键基因在表达水平、病理分期关系、患者生存分析和免疫组化分析，这样筛选出来的基因可能更具有临床意义，或将为HCC的诊断和治疗提供新的思路。

    1 材料与方法

    1.1 芯片来源 在GEO数据库(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/)中搜索关键词“Hepatocellular carcinoma”，选择“Homo sapiens、tissue、Expession profiling by array”，在数据集中挑选正常肝组织为对照组，人HCC组织为实验组。3张基因芯片，GSE14520，GSE84598，GSE84402分别有正常肝组织样本19、22、14例，人HCC组织样本有22、22、14例，平台分别为GPL3921、GPL10558、GPL570；2张miRNA数据芯片，GSE98269、GSE57555分别有正常肝组织样本3、5例，人HCC组织样本3、5例，平台分别为GPL20712、GPL18044。

    1.2 筛选差异表达基因 利用GEO2R在线分析工具对实验组和对照组数据进行分析，其中以|log2FC(fold change)|≥1.5和P1、P<0.05为标准对筛选得到的关键基因进行表达水平、病理分期关系、患者生存分析等 ......