成都市锦江区污水中猴痘病毒的监测及基因特征分析
基因组,1材料与方法,2结果,3讨论
陈 欣,曹誉龄,杨颖馨,曹 昊,敬小丽,郑月茂,缪瑞琦(1.成都市锦江区疾病预防控制中心检验科,四川 成都 610021;2.成都中医药大学医学技术学院生物分析教研室,四川 成都 611130)
猴痘病毒是痘病毒科的一员,是20世纪70年代在北非发现的一种病毒性人畜共患病。猴痘病毒可通过接触病变体液、呼吸道飞沫和受污染的物质在人与人之间传播[1]。2022年5月,非洲以外非流行地区的猴痘流行开始受到全世界的关注。2022年7月23日,世界卫生组织宣布猴痘为国际关注的突发公共卫生事件。据世卫组织数据,自猴痘疫情暴发以来,总共有111个国家和地区向世卫组织报告了超过8.7万例病例,包括140例死亡病例。2022年9月重庆报道了中国首例猴痘病例,2023年6月,成都也发现了猴痘,感染人数迅速上升。
快速识别疫情及聚集性对感染控制至关重要。污水监测已被认为是评估病原体传播的有力工具,已成功用于追踪SARS-CoV-2及其变体。研究表明,猴痘病毒DNA会从唾液、粪便、尿液、精液和皮肤病变中脱落[2],病毒基因组可能存在于污水中。因此,在2023年7~9月成都猴痘流行期间,跟踪监测了成都市第九污水处理再生水厂的污水,检测并分析污水中的猴痘病毒含量和基因特征,研究污水中猴痘病毒浓度与阳性报告病例发生率的相关性,探讨环境监测作为猴痘疫情监测补充手段的可行性和重要性。
1 材料与方法
1.1 材料
1.1.1 样本来源 对成都市第九污水处理再生水厂未经消杀处理的污水进行采样,采样方式为智能水质采样器24 h间断采样(即24 h不同时间所采集的瞬时水样混合为1个样本),采样体积为300 mL,每周采集检测2次,共检测了2023年7~9月的26个样本 ......
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