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编号:605098
新型冠状病毒核酸检测“假阴性”可能因素探析
http://www.100md.com 2021年11月30日 空军军医大学学报 2021年第2期
感染者,试剂盒,1SARS-CoV-2感染的实验室病原学检测,2SARS-CoV-2核酸检测“假阴性”可能的影响因素,1病原学因素与病毒核酸的检测,2样本因素与病毒核酸的检测,3病毒核酸不同提取方法与病毒核酸的检测
     廖远泉(安徽省泾县医院检验科,安徽 泾县 242500)

    我国学者率先检测发现并报道了一种新型冠状病毒[1]。2020年1月30日WHO建议将该新发现病毒命名为2019新型冠状病毒(new coronavirus,2019-nCoV)。2月11日,国际病毒分类委员会将其命名为 SARS-CoV-2(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2),WHO将其感染所致的肺炎命名为COVID-19(coronavirus disease 2019)[2]。流行病学研究提示,SARS-CoV-2已经在人际间广泛传播[3]。SARS-CoV-2 可经呼吸道飞沫、密切接触传播,传染源主要是 SARS-CoV-2 的感染者和病毒携带者[4]。SARS-CoV-2感染所导致的COVID-19已在世界许多国家/地区呈现广泛流行态势,是一种全球流行病(pandemic)。鉴于COVID-19是一种新发的感染性疾病,对SARS-CoV-2感染者早期明确诊断、阻断疫情扩散、控制发生新的感染十分重要。但临床实验诊断中SARS-CoV-2核酸检测假阴性问题时有发生,这对于病原体分子生物学核酸检测的准确性提出了更高的要求。文章就影响其实验诊断核酸检测“假阴性”可能的因素进行探析。

    1 SARS-CoV-2感染的实验室病原学检测

    SARS-CoV-2感染病原学检测技术主要有SARSCoV-2的细胞培养及其基因测序、核酸检测等。我国学者[1]发现的SARS-CoV-2即是将肺炎患者的支气管肺泡灌洗液接种到人类气道上皮细胞中进行培养、分离。采用透射电镜技术观察并初步描述了病毒特异性细胞病变及其病毒颗粒形态,并成功地对培养物的蛋白组分全基因组进行了测序、检测。虽然基因组测序诊断COVID-19具有很高的准确度,但测序仪器昂贵,且多数病毒的细胞培养出现病变需要5~10 d,培养的周期长、敏感度较低且不易观察培养结果,不适用于临床快速诊断以及大批量的检测。因此病毒培养与基因组测序适宜于病毒感染性疾病的实验研究,不宜作为SARS-CoV-2感染临床检验的首选诊断手段。

    核酸检测是目前SARS-CoV-2感染的主要实验诊断方法。现已建立的SARS-CoV-2特异性核酸检测技术其病毒目标片段是病毒基因组开放性读码框 ORF1ab、N基因或E基因保守区域进行引物设计。临床主要采用聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)、以及在该检测技术基础上优化的新的检测技术,如实时荧光定量聚合酶链式反应(Real-time fluorescence quantitative polymerase chain reaction ......

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