曹 嫄，李 宇，张克英，卢 通，韩东晖，李程彬，何伟翔，赵晓龙，徐志成，秦卫军，杨力军(空军军医大学西京医院：门诊部，泌尿外科，陕西 西安 7003)

    肾细胞癌(renal cell carcinoma，RCC)占所有恶性肿瘤的3%～5%，发病率居第16位，死亡率居第17位[1]。早期RCC患者主要以根治性手术治疗为主且预后较好，而进展期RCC预后较差且缺乏有效的治疗方法[2]。研究表明，RCC的进展与肿瘤免疫微环境密切相关，且总体免疫细胞浸润更丰富的患者预后更好[3]。然而，免疫细胞类型多样，不同免疫细胞在肿瘤恶性进展中的作用存在差异[4]。阐明具体的免疫细胞类型与肿瘤预后的相关性，并进一步指导临床决策意义重大。为此，本研究利用生物信息学方法，对检索自癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas，TCGA)数据库的RCC数据进行免疫细胞浸润量化和预后分析，以揭示免疫微环境与RCC恶性进展的相关性，为RCC预后预测和临床决策提供可靠的评价指标。

    1 对象与方法

    1.1 对象

    895例RCC患者基因表达数据和相应患者的临床信息，检索自TCGA数据库，包括肾透明细胞癌、肾乳头状癌和肾嫌色细胞癌。临床信息包括：生存时间、生存状态、年龄、性别、病理分期、TNM分期等。通过Perl软件将单个条目的TCGA数据整合成数据矩阵。利用R软件的limma程序包将重复测量的基因数据取均值并替换，得到基因表达矩阵。

    1.2 方法

    1.2.1 基于CIBERSORT算法的免疫细胞量化 利用R软件的CIBERSORT程序包和LM22特征基因表达矩阵，对上述RCC基因表达矩阵进行分析，量化得到每个患者肿瘤组织中22种免疫细胞的肿瘤浸润分数 ......