RPA-毛细管电泳检测人腺病毒55型的方法建立及初步应用
条带,1材料与方法,2方法,2结果,1HAdV55-Hexon质粒的鉴定结果,2引物的筛选,3特异性实验,4灵敏度实验,5重复性实验,6临床样品检测,3讨论
袁若栋,董阳超,武福星,段 甜,薛 潘,张 剑,袁明城,薛智丰,张海军,张欠欠,雷迎峰,高小朋(1延安大学生命科学学院,陕西 延安 716000;2空军军医大学基础医学院病原生物学与微生物学教研室,陕西 西安 710032)
腺病毒主要有A~G 7个血清学组,是导致人呼吸道感染的重要病原体。人腺病毒(human adenovirus,HAdV)现有100多个亚型,临床主要表现为发热、呼吸系统疾病、肠胃炎和结膜炎,在低免疫功能患者中,可能会导致呼吸衰竭,出现弥漫性感染、血性膀胱炎,引起神经系统疾病,甚至会导致死亡[1]。HAdV55属于B血清组,是HAdV11和HAdV14的重组体,我国最早从2006年陕西省岐山县暴发的疫情中分离获得[2]。HAdV55主要通过飞沫传播,感染后易出现急性呼吸道感染症状,例如发热、咳嗽、头痛、咽喉肿痛、支气管炎、肺炎、肝炎等,可发展成为重症肺炎[3]。HAdV的主要易感人群是婴儿、学生、新兵和免疫功能低下的患者[4-5]。目前临床上尚无针对腺病毒的特异治疗药物,多采用对症治疗。因此,早期诊断是HAdV55型防控的重点。
目前关于HAdV55的检测方法,主要包括病毒分离培养、鼻黏膜上皮脱落细胞直接免疫荧光检测病毒抗原、血清学检测和分子生物学方法[6]。前三种方法过程繁琐、耗时长,不适合早期诊断,聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)等分子生物学方法具有快速灵敏等优势,在临床检测中备受青睐[7]。但现有传统检测方法还只是基于Hexon基因部分序列进行分子分型的做法,主要是对各类临床样本进行核酸提取,设计相应引物,采用PCR进行检测,虽然市面上也已出现大量呼吸道病原体检测试剂盒,但无特异性针对HAdV55的检测试剂盒。而传统的PCR扩增检测技术,通过特异性引物对DNA片段进行体外扩增,包括巢式PCR、探针法和染料法实时荧光定量PCR等,这些技术具有高灵敏度、高特异性,技术较为成熟,适合早期临床诊断,但对实验条件、试剂成本、工作人员的技术要求高。基于基因芯片和基因测序技术在腺病毒检测方面也有报道[8-10],LI等[11]就采用了可获得更高的序列准确性的高通量测序:将纳米孔测序技术和华大基因平台应用于2019年5月中国湖北省HAdV55暴发的鉴定和基因组分析,但这两种主要适用于复杂感染情况下的鉴别诊断,且技术成本昂贵、复杂,检测灵敏度低,尚未在临床诊断HAdV55中广泛应用[12]。重组酶聚合酶扩增(recombinase polymerase amplification ......
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